維醫藥物品種繁多，常用藥有1100多種，其中礦物藥80多種，植物藥1000多種，動物藥50多種；國產的有1000多種，新疆產的100多種，進口藥有60多種。
　　一．植物類藥材
　　1．野生類有：阿魏、鎖陽、大蕓、雪蓮、甘草、貝母、麻黃、紫草、菊苣、阿里紅、毒參、藏茴香、刺山柑、園柏、歐洲鱗毛蕨、華松羅、旱梅衣、石花、車前、天仙子、菟絲子、千葉蓍、茵陳、一支蒿、牛至、駱駝蓬、刺糖、心草、藥蜀葵，睡蓮、水菖蒲、茜草等約70種。
　　2．栽培的種類有：小茴香、孜然、洋茴香、阿魏、芹菜、蒔羅、黑種草、草紅花、西紅花、芫荽、羅勒、藥西瓜、菘蘭、玫瑰花、薄菏、巴旦杏等30多種。
　　二．動物類藥材
　　海貍香、羚羊角、牛黃、鹿角、鹿茸、熊膽、雪雞、環頸雉、沙雞、蝮蛇、湖蛙、龍虱、家蟋蟀、全蝎等30多種。
　　三．礦物藥類
　　大青鹽、水銀、朱砂、石膏、白礬、硇砂、密陀僧、瑪瑙、滑石、硼砂、磁石、雌黃等約20種，合計150多種，約占其常用藥材的30％。
　　內地維吾爾藥材資源主要分布在我國長江以南的廣東、廣西、福建、臺灣、海南、云南、四川、江蘇、浙江等省區。這些省區屬熱帶、亞熱帶地區，主要有黑胡椒、白胡椒、蓽茇、訶子、阿勃勒、余甘子、干姜、姜黃、莪術、蓽茇茄、沉香、西谷米、檸檬、枸櫞、椰子、香茅、巴豆、馬錢子、肉豆蔻、檳榔、草果、丁香、苦楝子、肉桂、高良姜、土茯苓、骨碎補、大黃、黃連、木香、香附等180多種，約占常用藥材的40％。
　　維吾爾藥材在國外主要分布于北非的埃及、南歐（地中海一帶）、亞洲阿拉伯半島、伊朗、中亞、印度、巴基斯坦等國家和地區。主要藥材有：安息香、蘇合香、香沒藥樹、洋橄欖、血竭、乳香、沒藥、沒食子、馬錢子、沉香、海蔥、茄參、蜜蜂花、海貍香、龍涎香、洋乳香、漿果紅豆杉、破布木果、洋菝葜、藥喇叭根、番瀉葉、歐細辛、檀香、西青果、沙龍子、歐當歸、印度當藥、西黃芪膠、非洲醉茄、亞麻車前、尤太石等150多種，約占維吾爾醫常用藥材的30％。