（3）說明臟腑生理功能與某些相互聯系
中醫學根據五行之特性，用以說明五臟的某些生理特性和功能作用。如木性可曲可直，條順而暢達，肝屬木，故肝喜條達而惡抑郁，并有疏泄之功能；火性溫熱而炎上，心屬火，故心陽有溫煦之功能，心火易于上炎；土性敦厚，有生化萬物之特性，脾屬土，故脾有消化水谷，運輸精微，營養五臟六腑、四肢百骸的功能，又為氣血生化之源；金性清肅收斂，肺屬金，故肺具有清宣肅降之功能；水性潤下，有下行、閉藏之性，腎屬水，故腎主水液代謝之蒸化排泄，并有藏精功能。
中醫學認為五臟的功能活動不是孤立的，而是相互聯系著的。五臟是人體生理活動的中心。五臟之間在生理上相互聯系、相互協調，共同完成整體的生理活動。五臟配屬五行，不僅闡明了五臟的某些功能特點，而且認為五臟之間存在著相互資生和相互制約的聯系，并由此說明五臟之每一臟都與其它四臟發生著關系，從而概括出五臟的整體聯系。試從相克和相生兩方面來進行敘述如下：
臟腑之間的相互資生聯系，如腎能藏精，肝能藏血，腎精可以化生肝血，此即腎水滋養肝木，即水生木；肝藏血，心主血脈，肝之貯藏血液和調節血量功能正常，則有助于心主血脈功能的正常發揮，此即肝木上濟心火，即木生火；心主血脈，又主神志，脾主運化，為氣血生化之源，又主統血，心之陽熱可以溫運脾陽，心主血脈功能正常，血能榮脾，脾才能發揮主運化、生血、統血之功能，此即心火溫運脾土，即火生土；脾能轉輸精微，益氣以充肺，從而維持肺主氣之功能，并使之宣肅正常，此為脾氣生養肺氣，即土生金；肺主氣，職司清肅，腎主藏精納氣，肺氣肅降則有助于腎精之閉藏和氣之攝納，肺氣肅降，水道通調，又能促進腎主水功能的發揮，此即肺金滋養腎水，即金生水。
可以看出，五臟之間相互資生的關系，即是運用五行相生的理論來闡明的。
臟腑之間的相互制約關系，如肺氣肅降，氣機調暢，可以抑制肝氣之上逆和肝陽之上亢，此即金克木；肝氣的條達，可以疏泄脾濕之壅滯，此即木克土；脾氣運化，可以調節腎主水功能，以防止水濕之泛濫，此即土克水；腎水的滋潤，上濟于心，以制約心火的亢炎，此即水克火；心之陽熱，可以制約肺氣的清肅太過，此即火克金。亦可看出，五臟之間在生理功能上的相互制約，亦是運用五行相克理論來闡明的。
總之，五臟之間的生克關系，說明每一個臟在功能上均有他臟資助，因而本臟不至于虛損；又能制約其它臟，因而使它臟不致過亢；若本臟之氣過盛，則有他臟之氣制約之；而本臟之氣虛損，則又有他臟之氣以滋養之。可見，通過這種生克關系，即把臟腑緊密地聯結成一個整體，從而維持了人體內環境的協調統一。
此外，關于人體與外界環境，如四時、五氣，以及飲食五味的關系，中醫學亦是用五行之規律來加以說明的，在此不一一列舉說明。
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